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Pereira, Igor Avila
(2014)
Na vida cotidiana, as pessoas agrupam objetos de forma inconsciente, sem saber exatamente como a seleção de objetos que compõem um determinado grupo é feita. Assim, é uma característica da aprendizagem humana considerar o ...
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Seus, Vinicius Rosa; Perazzo, Giovanni Xavier; Winck, Ana Trindade; Werhli, Adriano Velasque; Machado, Karina dos Santos
(2014)
The receptor-ligand interaction evaluation is one important step in rational drug design. The databases that provide the structures of the ligands are growing on a daily basis. This makes it impossible to test all the ...
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Freitas, Eduardo Kenji Hasegawa de
(2020)
O refinar de propriedades das proteínas, através de mutações pontuais sobre seus aminoácidos é uma prática muito comum utilizada em processos da indústria bioquímica. Métodos computacionais acurados são necessários para ...
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Barros, Rodrigo Coelho; Winck, Ana Trindade; Machado, Karina dos Santos; Basgalupp, Márcio Porto; Carvalho, Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de; Ruiz, Duncan Dubugras Alcoba; Souza, Osmar Norberto de
(2012)
Background: This paper addresses the prediction of the free energy of binding of a drug candidate with enzyme
InhA associated with Mycobacterium tuberculosis. This problem is found within rational drug design, where ...
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Seus, Vinicius Rosa
(2016)
Bancos de dados públicos como o PDB (Protein Data Bank), NCBI protein e ZINC possuem uma enorme quantidade de dados armazenados. Com esta grande quantidade de dados, fica evidente que o uso de ferramentas que realizam a ...
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Winck, Ana Trindade; Machado, Karina dos Santos; Souza, Osmar Norberto de; Ruiz, Duncan Dubugras Alcoba
(2013)
Background: Data preprocessing is a major step in data mining. In data preprocessing, several known techniques
can be applied, or new ones developed, to improve data quality such that the mining results become more
accurate ...
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Cohen, Elisangela Machado Leal; Machado, Karina dos Santos; Cohen, Marcelo; Souza, Osmar Norberto de
(2011)
Background: Protein/receptor explicit flexibility has recently become an important feature of molecular docking
simulations. Taking the flexibility into account brings the docking simulation closer to the receptors’ real ...
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Camargo, Alex Dias
(2017)
A metodologia abordada nesta dissertação é baseada na combinação dos resultados de diferentes ferramentas de predição do impacto de mutações pontuais em proteínas, assumindo-se o pressuposto de Ensemble Learning na qual a ...
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Quaresma Junior, Wolmer Dias
(2019)
O objetivo desta dissertação é propor uma ferramenta para tratar um problema importante da biologia computacional, que corresponde na localização de um determinado aminoácido em uma sequência biológica para que possa obter ...
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Machado, Karina dos Santos; Schroeder, Evelyn Koeche; Ruiz, Duncan Dubugras Alcoba; Cohen, Elisangela Machado Leal; Souza, Osmar Norberto de
(2011)
Background: In silico molecular docking is an essential step in modern drug discovery when driven by a well
defined macromolecular target. Hence, the process is called structure-based or rational drug design (RDD). In ...
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Arce, Oscar Emilio Arrua
(2020)
No desenho de fármacos, as scoring functions ou funções de escore são úteis para prever as afinidades de ligação dos complexos proteína-ligante. O constante aumento dos dados bioquímicos e biofísicos, juntamente com o ...
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Tomasini, Caroline
(2015)
A validação dos resultados de agrupamento é uma questão importante na área de aprendizado de máquina e é essencial para o sucesso das aplicações relacionadas a agrupamento de dados. No entanto, escolher o índice de validação ...
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Tomasini, Caroline
(2015)
A validação dos resultados de agrupamento é uma questão importante na área de aprendizado de máquina e é essencial para o sucesso das aplicações relacionadas a agrupamento de dados. No entanto, escolher o índice de validação ...
